धार्मिक कथाओं के मुताबिक, जब माता सुभद्रा ने द्वारका नगरी घूमने की इच्छा व्यक्त की, तो भगवान जगन्नाथ अपने भाई बलभद्र और बहन सुभद्रा के साथ अपनी मौसी के निवास स्थान यानी गुंडिचा मंदिर गए थे। वहां कुछ दिन आराम करने के बाद, वे बहुदा यात्रा के जरिए वापस श्रीमंदिर लौट आए थे। इसी स्नेह और याद में हर साल यह रथयात्रा आयोजित की जाती है।